《明末：渊虚之羽》Steam版自发售之后就因为游戏优化以及豪华版特典发送错误的问题导致大量玩家差评。对于这些问题，本作开发商灵泽科技表示游戏优化糟糕的问题“本不应该发生”，并且他们对于玩家们在游戏中所遇到的各种问题深表遗憾。开发团队对于《明末：渊虚之羽》在推荐配置下的表现充满信心，但是他们也在对游戏进行进一步优化。
根据官方的反馈，目前《明末：渊虚之羽》的优化计划包括：
- 优化显存处理部分显卡上帧数和卡顿的问题
- 优化部分显卡上默认设置
- 修正倒地起身速度
- 减少部分陷阱的伤害和数量
- 降低部分低级怪物的冲击力抗性
- 降低部分区域探索压力
- 处理部分因为道具缺失导致的任务中断问题
- 优化部分怪物和BOSS的AI逻辑
- 优化部分区域纹理质量过低的问题
- 优化部分资产精度过低的问题
同时对于《明末：渊虚之羽》豪华版特典发送错误问题的补偿，豪华版玩家在原本补偿游戏ost原声集的基础上再次追加了三套豪华套装和四把武器。标准版和豪华版玩家都将会额外获得三件头部装备。